27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1771 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  237  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  79.83 
 
 		 134 aa  190  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  47.01 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  46.09 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  44.83 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  44.44 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  43.75 
 
 		 174 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  43.97 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  41.23 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  39.82 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  42.35 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  36.97 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  37.39 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  38.26 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  35.65 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  40 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  46.75 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  35.4 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  45.21 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  43.08 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  42.86 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  37.07 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  37.66 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  33.6 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  33.6 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  31.97 
 
 		 211 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  33.6 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>