33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0933 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  100 
 
 
159 aa  312  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  44.9 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  39.01 
 
 
145 aa  94  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  44.68 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  40.43 
 
 
145 aa  90.5  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  41.77 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  38.93 
 
 
140 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  39.44 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  40.44 
 
 
166 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  36.88 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  36.88 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  36.88 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  38.04 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  34.93 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  42.36 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  44 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  42.03 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  36.36 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  38.97 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  36.71 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  34 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  34.16 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  40.27 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  36.81 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  35.29 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  37.86 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  36.08 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  34.38 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  44.44 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  36.17 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  29.73 
 
 
160 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  31.78 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  26.35 
 
 
327 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>