36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3141 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3141  RDD  100 
 
 		 134 aa  259  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  79.83 
 
 		 125 aa  176  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  44.8 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  46.46 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  45.24 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  46.96 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  41.73 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  38.97 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  39.68 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  40.29 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  38.89 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  36 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  40.62 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  40.8 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  36.97 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  39.13 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  45.78 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  37.12 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  37.19 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  33.86 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  32 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  32 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  32 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  32 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  34.88 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  36.51 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  33.1 
 
 		 668 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  32 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  39.74 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  31.03 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  31.2 
 
 		 156 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  33.07 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  24 
 
 		 431 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>