63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3101 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  100 
 
 		 160 aa  311  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  53.75 
 
 		 154 aa  157  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  54.61 
 
 		 152 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  48.32 
 
 		 145 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  46.15 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  46.67 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  54.39 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  46.54 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  43.4 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  42.04 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  41.54 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  45.24 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  40.27 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  37.67 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  44.88 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  39.6 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  41.48 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  41.1 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  41.35 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  37.11 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  37.11 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  37.11 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  38.31 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  32.12 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  39.55 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  34.84 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  43.59 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  42.02 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  38.06 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  42.97 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  35.88 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  34.92 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  32.47 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  31.82 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  28.76 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  28.76 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3567  RDD domain-containing protein  35.2 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  31.01 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  31.78 
 
 		 634 aa  44.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1449  RDD domain-containing protein  35.34 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.413718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  34.29 
 
 		 415 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  34.29 
 
 		 412 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  34.94 
 
 		 154 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  34.29 
 
 		 415 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  34.29 
 
 		 412 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 449 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  36.36 
 
 		 376 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  35.53 
 
 		 444 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  35.53 
 
 		 448 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  37.65 
 
 		 327 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  26.8 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  26.8 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  36.05 
 
 		 272 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  29.06 
 
 		 211 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  34.29 
 
 		 398 aa  40.8  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  26.8 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  30.85 
 
 		 276 aa  40.4  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  40.91 
 
 		 175 aa  40.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>