65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3843 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  100 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  47.81 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  46.67 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  46.29 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  50.72 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  46.26 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  48.86 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  43.42 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  47.58 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  35.41 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  41.4 
 
 		 265 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  33.18 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  34.26 
 
 		 279 aa  95.1  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  33.63 
 
 		 254 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  39.06 
 
 		 343 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  39.02 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  37.66 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  31.92 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  31.92 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  31.92 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  31.11 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  29.33 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  40.14 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  32.84 
 
 		 285 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  30.99 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 590 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  41.3 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  35.84 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  29.21 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  31.19 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  41.94 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  37.96 
 
 		 327 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  29.49 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  33.99 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  33.02 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  35.12 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  31.82 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  35.14 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  34.18 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  40.23 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  29.52 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  27.15 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  33.74 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  43.18 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  28.12 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  28.77 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  32.12 
 
 		 323 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  26.35 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  29.94 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  44.29 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  29.24 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  34.18 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  35.44 
 
 		 198 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  32.26 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  29.5 
 
 		 323 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  40.82 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  26.97 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 536 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  26.09 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  36.19 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  36.56 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  34.52 
 
 		 194 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  33.75 
 
 		 137 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  31.68 
 
 		 635 aa  41.6  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>