27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0141 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 327 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  72.09 
 
 		 327 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  59.02 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  59.02 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  59.02 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  51.08 
 
 		 322 aa  258  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  44.58 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  51.47 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  37.27 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  41.74 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  32.43 
 
 		 198 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  31.87 
 
 		 168 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  37.5 
 
 		 240 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  30.64 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  26.79 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  37.18 
 
 		 167 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  40.85 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  25.16 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  30.99 
 
 		 165 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  31.43 
 
 		 141 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  23.57 
 
 		 205 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  27.4 
 
 		 162 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  30.93 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  42 
 
 		 202 aa  42.7  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  30.99 
 
 		 165 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  33.82 
 
 		 185 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>