25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1981 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  100 
 
 
357 aa  699    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  51.7 
 
 
319 aa  129  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  48.98 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  44.22 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  44.09 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  45.12 
 
 
167 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  28.4 
 
 
272 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  33.55 
 
 
240 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  31.79 
 
 
168 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  29.87 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  32.03 
 
 
198 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  47.95 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  41.67 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  28.87 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  44.93 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  44.93 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  44.93 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  29.81 
 
 
169 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  28.19 
 
 
150 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  22.42 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  32.61 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  31 
 
 
274 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  34.72 
 
 
202 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.81 
 
 
261 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  32.92 
 
 
668 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>