48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4817 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  42 
 
 		 373 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  41.82 
 
 		 272 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  35.95 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  36.25 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  31.61 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  33.54 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  33.55 
 
 		 361 aa  68.2  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  32.24 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  32.48 
 
 		 319 aa  62  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  33.8 
 
 		 393 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  35.57 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  26.15 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  30 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  32.43 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  31.98 
 
 		 447 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  40.38 
 
 		 313 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  27.15 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  28.74 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  28.77 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  28.65 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  35.62 
 
 		 357 aa  51.6  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  35.71 
 
 		 322 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  37.84 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  37.14 
 
 		 327 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  34.72 
 
 		 323 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  34.72 
 
 		 323 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  34.72 
 
 		 323 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  31.48 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  27.27 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  32.41 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  27.88 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.27 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  28.35 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  25.61 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  28.08 
 
 		 154 aa  45.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  29.56 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  34.33 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  31.58 
 
 		 310 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  35.38 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  40 
 
 		 375 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  29.41 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  35.29 
 
 		 590 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  36.76 
 
 		 261 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  28.11 
 
 		 185 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  31.13 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>