46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4654 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  33.33 
 
 		 447 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  29.93 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 393 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  33.6 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  32.8 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  28.34 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  27.59 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  26.7 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  45.45 
 
 		 985 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  25.67 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  25.4 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  41.25 
 
 		 971 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3438  hypothetical protein  35.51 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  25.56 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  45.56 
 
 		 1299 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0674  RDD  31.39 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2227  hypothetical protein  45.92 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  50.7 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  24.62 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  25.84 
 
 		 689 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  22.75 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  29.45 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3357  RDD family membrane protein  23.57 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0260303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  23.46 
 
 		 165 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  38.37 
 
 		 1131 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5978  hypothetical protein  59.32 
 
 		 305 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128515  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3124  hypothetical protein  29.79 
 
 		 281 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000741155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  24.02 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  62.96 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  62.71 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  26.97 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  63.89 
 
 		 499 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  29.09 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.41 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf584  virulence-associated lipoprotein MIA  31.51 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0652484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  23.78 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  29.35 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  24.69 
 
 		 710 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  27.34 
 
 		 150 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  50.68 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  28.12 
 
 		 191 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2450  RDD domain-containing protein  29.75 
 
 		 221 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0128702  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2378  RDD domain-containing protein  29.75 
 
 		 221 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000398185  normal  0.783398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  31.48 
 
 		 514 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>