95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1375 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  100 
 
 		 157 aa  323  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  35.76 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  33.93 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  31.03 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02664  RDD family, putative  33.33 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  31.87 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  31.87 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  31.87 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  30.91 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  31.48 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  26.97 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  29.19 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  27.45 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  28.48 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  29.38 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  28.38 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.43 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  30.49 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  29.38 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  33.75 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  28.93 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  28.08 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  31.16 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  27.45 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  30.34 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  27.57 
 
 		 220 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  30.34 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  30.99 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  28.29 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  29.31 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  27.63 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  29.03 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  27.63 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  29.7 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  27.37 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  27.34 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  28.22 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  27.78 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  28.75 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  25.97 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  26.92 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  26.32 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  26.95 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  31.08 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  27.69 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  27.74 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  28.28 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  32.24 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  29.78 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  26.39 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  26.86 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  36.9 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  24.84 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01573  RDD domain containing protein  27.4 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566459  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  32.58 
 
 		 634 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  31.65 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  30.56 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  26.54 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  33.73 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  25.77 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  29.45 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  26.38 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  25.15 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  26.97 
 
 		 264 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  34.33 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  30.95 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  28.3 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2026  RDD domain-containing protein  23.76 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  26.19 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  34.78 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 254 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  28.09 
 
 		 182 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2964  hypothetical protein  29.32 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  28.16 
 
 		 191 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  24.54 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  24.53 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  33.67 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  22.7 
 
 		 169 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  24.54 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  24.54 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1619  RDD  28.74 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  24.54 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  29.49 
 
 		 406 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  27.63 
 
 		 152 aa  40.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>