23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4672 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  100 
 
 
168 aa  340  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  59.87 
 
 
167 aa  183  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  51.57 
 
 
240 aa  154  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  35.95 
 
 
198 aa  89  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  32.3 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  39.62 
 
 
361 aa  77  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  30.97 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  33.91 
 
 
365 aa  64.3  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  43.24 
 
 
357 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  31.87 
 
 
327 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  32.5 
 
 
319 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  29.68 
 
 
327 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  22.75 
 
 
264 aa  47.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  26.97 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  44.23 
 
 
323 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  44.23 
 
 
323 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  44.23 
 
 
323 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  21.05 
 
 
140 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  38.57 
 
 
169 aa  42  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  25.16 
 
 
154 aa  42  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  34.85 
 
 
322 aa  40.8  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  31.48 
 
 
175 aa  40.8  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>