77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0446 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  384  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  37.5 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  26.37 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  28.27 
 
 
247 aa  67.8  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  40.4 
 
 
347 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  32.26 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.41 
 
 
258 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  25.84 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  29.13 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  33.68 
 
 
447 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  32.69 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  32.28 
 
 
393 aa  58.9  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.44 
 
 
270 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  30.67 
 
 
167 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  30.85 
 
 
191 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  30.25 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  31.85 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  30.3 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  29.36 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  31.95 
 
 
668 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  33.33 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  29.05 
 
 
310 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  26.01 
 
 
242 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  25.76 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  29.41 
 
 
397 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  32.91 
 
 
537 aa  48.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  29.45 
 
 
175 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  35.54 
 
 
449 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  33.88 
 
 
448 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  33.88 
 
 
444 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  28.57 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
313 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  28.67 
 
 
463 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  26.9 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  26.21 
 
 
295 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  44.16 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  39.47 
 
 
415 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  39.47 
 
 
412 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  39.47 
 
 
415 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  32.89 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  30.67 
 
 
157 aa  45.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  39.47 
 
 
412 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  38.1 
 
 
327 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  26.35 
 
 
131 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  29.75 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2240  RDD domain containing protein  35.35 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  40.85 
 
 
327 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  29.3 
 
 
246 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  27.92 
 
 
140 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  30.46 
 
 
257 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  37.21 
 
 
376 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  27.98 
 
 
511 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  24.68 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  34.52 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  33.72 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  30.07 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  27.1 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  27.85 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  36.62 
 
 
375 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  29.14 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  29.76 
 
 
162 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  30.72 
 
 
173 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  29.01 
 
 
327 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  31.25 
 
 
149 aa  42.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  27.93 
 
 
162 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 
424 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  27.59 
 
 
165 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  36.51 
 
 
323 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  36.51 
 
 
323 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  32.98 
 
 
278 aa  41.6  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  36.51 
 
 
323 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.82 
 
 
167 aa  41.6  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  28.16 
 
 
165 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  26.8 
 
 
365 aa  41.2  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 
375 aa  41.2  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  29.68 
 
 
272 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>