79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0170 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  45.45 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  47.26 
 
 		 187 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  39.16 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  42.47 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  45.21 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  44.37 
 
 		 186 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  45.83 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  42.47 
 
 		 217 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  37.76 
 
 		 295 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  32.16 
 
 		 202 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  34.97 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 		 415 aa  77  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  34.78 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  34.29 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  37.66 
 
 		 202 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  32.64 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 456 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  37.5 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 		 536 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  30.13 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  46.58 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  32 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  33.56 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  31.52 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  31.97 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  28.75 
 
 		 246 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  28.48 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  31.97 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  35.53 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  29.45 
 
 		 156 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  24.49 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  28 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  32.05 
 
 		 453 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  32.87 
 
 		 278 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  31.58 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  34.21 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  29.33 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  36.17 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  36.84 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  32.41 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  30.98 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  28.05 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  28.77 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0792  hypothetical protein  26.67 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 		 634 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  38.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  26.21 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  30.61 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  30.57 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  32.08 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  27.86 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 449 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  29.17 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 444 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  28.85 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  34.18 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 448 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  34.62 
 
 		 590 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  28.95 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  25.85 
 
 		 154 aa  42  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  30.85 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0824  hypothetical protein  70 
 
 		 43 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  28.28 
 
 		 150 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  34.33 
 
 		 149 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  29.58 
 
 		 280 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  37.14 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  27.5 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  26.06 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  23.33 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  33.75 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  26.95 
 
 		 447 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  29.5 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0269  RDD domain-containing protein  39.39 
 
 		 317 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>