39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0269 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_0269  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0269  RDD domain containing protein  59.76 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0248  RDD  56.91 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0258  RDD domain containing protein  60.98 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  38.04 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  31.76 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  38.76 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  38.46 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  31.94 
 
 		 170 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  30.56 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  48.48 
 
 		 202 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  40.22 
 
 		 185 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 415 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  36.19 
 
 		 204 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  40 
 
 		 162 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  38.75 
 
 		 194 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  27.17 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  35.29 
 
 		 175 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  33.1 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  33.67 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  37.08 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  37.08 
 
 		 165 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  34.57 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  37.84 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  30 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  40 
 
 		 77 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  40.26 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  33.67 
 
 		 162 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  35.44 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  35.44 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  35.44 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  33.67 
 
 		 162 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  35.44 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  33.67 
 
 		 162 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  30.48 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 536 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  36.23 
 
 		 165 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 205 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>