43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0425 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  44.9 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  43.62 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  42.95 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  39.6 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  42.55 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  37.16 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  38.51 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  33.01 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  35.71 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  36.59 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  29.29 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  31.29 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  38.57 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  26.53 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  27.4 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  31.03 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  34.85 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  28.09 
 
 		 242 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  34.15 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.76 
 
 		 258 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  25.83 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  28.78 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  32.81 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  27.07 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  32.81 
 
 		 279 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 		 246 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  29.9 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  34.33 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  37.68 
 
 		 634 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  26.67 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  27.74 
 
 		 463 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  28.26 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  26.76 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  28.97 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1033  RDD domain-containing protein  32.95 
 
 		 332 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  33 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  34.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  25.19 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>