51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  31.36 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  32.1 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  26.67 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  36.52 
 
 		 537 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  32.14 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  30.38 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  28.94 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  32.38 
 
 		 154 aa  52  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  31.4 
 
 		 149 aa  52  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  23.93 
 
 		 150 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  27.64 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  23.35 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  34.51 
 
 		 463 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  21.64 
 
 		 149 aa  50.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  42.11 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.25 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  30.06 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  20.62 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  20.62 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  20 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  27.22 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  29.63 
 
 		 373 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  22.64 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  36.59 
 
 		 511 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  34.62 
 
 		 349 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  27.33 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  33.65 
 
 		 166 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  26.22 
 
 		 174 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  25.76 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1497  RDD domain-containing protein  25.49 
 
 		 163 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  27.67 
 
 		 187 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  30.41 
 
 		 347 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  33.72 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  38.38 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  35.37 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  33.11 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1681  RDD domain containing protein  26.16 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  28.89 
 
 		 451 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  35.53 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  31.65 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  26.11 
 
 		 295 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 		 166 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  32.53 
 
 		 80 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  27.59 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  34.12 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  28.08 
 
 		 133 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  36.08 
 
 		 313 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2964  hypothetical protein  25.32 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  29.24 
 
 		 447 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  28.85 
 
 		 168 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>