16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2700 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  100 
 
 		 537 aa  992    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  26.71 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  40.87 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  38.52 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  35.67 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05580  FHA domain-containing protein  37.74 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  39.36 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0963  forkhead domain protein  30.83 
 
 		 210 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  34.09 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  33.33 
 
 		 167 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  38.14 
 
 		 272 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  38.1 
 
 		 152 aa  47  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  24.79 
 
 		 373 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04060  uncharacterized conserved protein, contains FHA domain  32.04 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00580862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  33.77 
 
 		 194 aa  44.3  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  33.98 
 
 		 167 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>