16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1681 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1681  RDD domain containing protein  100 
 
 		 156 aa  321  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1103  hypothetical protein  41.67 
 
 		 284 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  34.29 
 
 		 310 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1497  RDD domain-containing protein  26.76 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1594  hypothetical protein  27.56 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00724024  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  33.93 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  33.93 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  33.93 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  31.78 
 
 		 288 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  25.71 
 
 		 323 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  34.26 
 
 		 261 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  30.22 
 
 		 310 aa  41.2  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  28.07 
 
 		 264 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  40 
 
 		 269 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  30.49 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>