45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0598 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  100 
 
 		 151 aa  306  4e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  49.66 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  50 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  48.63 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  44.9 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  43.88 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  39.04 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  37.84 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  37.67 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  36.99 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  31.01 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  27.34 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  34.48 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  32.21 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  32.22 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  31.52 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  32.39 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  36.76 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  38.81 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  27.73 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  32.86 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  36.71 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  29.41 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  29.41 
 
 		 279 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  37.35 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.66 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 634 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  35.21 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  29.89 
 
 		 295 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  25.9 
 
 		 310 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  24.2 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5636  RDD domain-containing protein  25 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  29.85 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  27.82 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1033  RDD domain-containing protein  34.44 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.94 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  25.32 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  29.67 
 
 		 278 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  25 
 
 		 272 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 536 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  29.09 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  24.14 
 
 		 257 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  33.7 
 
 		 155 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>