21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0474 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  304  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  97.33 
 
 
150 aa  296  7e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  96 
 
 
150 aa  295  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  49.32 
 
 
152 aa  152  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  40.94 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  37.16 
 
 
149 aa  121  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  41.61 
 
 
151 aa  120  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  42.28 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  39.04 
 
 
151 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  34.27 
 
 
141 aa  90.1  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  32.89 
 
 
406 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  27.01 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  26.62 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  25.85 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  31.43 
 
 
216 aa  46.2  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  30.22 
 
 
278 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  28.99 
 
 
634 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  27.89 
 
 
257 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  33.82 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  33.82 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  24.66 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>