79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3024 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  43.66 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  42.58 
 
 		 169 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  46.76 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  36.56 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  30.06 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  37.5 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  37.11 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  35.71 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  34.04 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  42.31 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  34.88 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  34.67 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  29.34 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  39.08 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  28.47 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.93 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  31.61 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  31.39 
 
 		 634 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  31.88 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  40 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  33.12 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  32.9 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  28.22 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  43.04 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  29.55 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  29.66 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.73 
 
 		 258 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  28.15 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  35.9 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  39.24 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  39.24 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  39.24 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  34.18 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  28.79 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  37.97 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0161  RDD  36.36 
 
 		 328 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  33.78 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  26.34 
 
 		 276 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  36.11 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  28.79 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  25.19 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  27.74 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  28.67 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  29.58 
 
 		 257 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  25.97 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  32.67 
 
 		 537 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  26.14 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  29.78 
 
 		 310 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  25 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  34.33 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  31.51 
 
 		 361 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  31.94 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  31.51 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  30.38 
 
 		 255 aa  44.3  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  36.62 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  24.68 
 
 		 357 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  31.33 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  33.33 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  30 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  29.5 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  26.04 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  25.81 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  33.8 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  27.96 
 
 		 406 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  26.75 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0342  RDD protein  27.43 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  31.94 
 
 		 151 aa  42  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  24.62 
 
 		 154 aa  42  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  23.91 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  30.92 
 
 		 211 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  26.13 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  32.97 
 
 		 498 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>