More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2564 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  100 
 
 		 498 aa  1025    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  47.18 
 
 		 378 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  46.61 
 
 		 390 aa  333  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  43.73 
 
 		 392 aa  326  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  43.34 
 
 		 389 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  54.89 
 
 		 302 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  39.2 
 
 		 364 aa  276  5e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  40.36 
 
 		 517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  39.79 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  38.99 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  36.75 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  37.63 
 
 		 517 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  36.18 
 
 		 530 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  37.36 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  32.41 
 
 		 356 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  31.87 
 
 		 276 aa  172  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  30.97 
 
 		 279 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  30.45 
 
 		 289 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  30.14 
 
 		 268 aa  141  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  31.16 
 
 		 276 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  28 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  27.95 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  27.95 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  27.95 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  27.95 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  26.9 
 
 		 380 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  27.95 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  33.48 
 
 		 276 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  35.4 
 
 		 275 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  26.57 
 
 		 324 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  28.01 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  27.36 
 
 		 299 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.33 
 
 		 219 aa  97.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  26.77 
 
 		 362 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  30.15 
 
 		 249 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  31.43 
 
 		 220 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  32.1 
 
 		 216 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  34.51 
 
 		 247 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  30.43 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  33.53 
 
 		 225 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  32.6 
 
 		 248 aa  87.8  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  32.6 
 
 		 248 aa  87.8  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  33.11 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  35.21 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  33.83 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  33.83 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  34.46 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.7 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  35.9 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  33.33 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  35.9 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  29.71 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  37.5 
 
 		 297 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  35.26 
 
 		 297 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  35.26 
 
 		 297 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  33.1 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  35.26 
 
 		 297 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  35.26 
 
 		 297 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  32.62 
 
 		 247 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  32.28 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  33.73 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0782  signal peptidase I  24.86 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  33.56 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  32.18 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  26.67 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  30.41 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  32.21 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1173  signal peptidase I  27.86 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.478468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  32.32 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  33.33 
 
 		 251 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  33.1 
 
 		 236 aa  80.1  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  30.14 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  35.82 
 
 		 253 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  34.33 
 
 		 252 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  30.59 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  33.1 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  31.72 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  33.33 
 
 		 251 aa  79.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  30.14 
 
 		 279 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  31.13 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  30.14 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  34.88 
 
 		 252 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  34.33 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  30.34 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  29.65 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  34.33 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  29.65 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  34.11 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  28.79 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  31.72 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  31.54 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  33.33 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  31.03 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.97 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.78 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  36.29 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  36.29 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  36.29 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  36.29 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  36.29 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>