16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0257 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  266  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  97.06 
 
 
140 aa  261  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  97.79 
 
 
136 aa  261  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  75 
 
 
138 aa  207  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2108  RDD protein  48.89 
 
 
139 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1846  RDD family protein  45.59 
 
 
139 aa  114  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0342  RDD protein  50 
 
 
139 aa  104  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1779  RDD protein  39.71 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2282  RDD domain containing protein  38.1 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  34.15 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  28.79 
 
 
167 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  27.07 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  27.07 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  25.38 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  22.14 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0949  hypothetical protein  30.6 
 
 
163 aa  40.4  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>