14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0283 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  273  7e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  97.79 
 
 
136 aa  263  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  97.06 
 
 
136 aa  261  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  73.19 
 
 
138 aa  206  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2108  RDD protein  48.15 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1846  RDD family protein  44.12 
 
 
139 aa  111  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0342  RDD protein  50.48 
 
 
139 aa  104  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2282  RDD domain containing protein  38.52 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1779  RDD protein  38.52 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  34.38 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  29.93 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  26.92 
 
 
154 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  27.07 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  21.37 
 
 
135 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>