12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1846 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1846  RDD family protein  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2108  RDD protein  67.15 
 
 
139 aa  191  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0342  RDD protein  56.3 
 
 
139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1779  RDD protein  50 
 
 
137 aa  128  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  45.59 
 
 
136 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  44.85 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  44.12 
 
 
140 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  44.12 
 
 
138 aa  106  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  39.39 
 
 
154 aa  101  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2282  RDD domain containing protein  38.46 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  30.88 
 
 
152 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  24.83 
 
 
151 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>