14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2282 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2282  RDD domain containing protein  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  38.51 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  40.14 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2108  RDD protein  38.93 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  38.52 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  38.1 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  38.52 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0342  RDD protein  41.22 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1846  RDD family protein  38.46 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1779  RDD protein  37.5 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  27.46 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  27.78 
 
 		 279 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  25.3 
 
 		 184 aa  40.4  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  28.39 
 
 		 217 aa  40.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>