15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1510 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  100 
 
 		 138 aa  267  4e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  75 
 
 		 136 aa  207  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  73.19 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  73.53 
 
 		 136 aa  205  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2108  RDD protein  48.18 
 
 		 139 aa  124  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1846  RDD family protein  44.12 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1779  RDD protein  41.48 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0342  RDD protein  45.86 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2282  RDD domain containing protein  40.14 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  36.07 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  28.15 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  25.53 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  26.81 
 
 		 154 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  31.11 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  29.5 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>