66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1499 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  100 
 
 
174 aa  338  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.22 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  57.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  29.75 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  29.75 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  29.75 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  36.25 
 
 
166 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  31.72 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  29.75 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  35.48 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  41.03 
 
 
162 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  30.38 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  35.38 
 
 
270 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  32.9 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  30.85 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  27.08 
 
 
257 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  28.48 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  30.85 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  33.78 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  34.04 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  36.67 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  29.86 
 
 
152 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  29.87 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  26.4 
 
 
205 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  32.56 
 
 
406 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  24.49 
 
 
278 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 
536 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  27.1 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  38.67 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  36.36 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  28.48 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5636  RDD domain-containing protein  35.25 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  27.46 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  32.63 
 
 
196 aa  44.7  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  27.56 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  30.14 
 
 
274 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 
165 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  30.99 
 
 
164 aa  44.3  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
634 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  36.84 
 
 
319 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  35.53 
 
 
276 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 
449 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  25 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 
415 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2964  hypothetical protein  25.5 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  31.03 
 
 
453 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  28.49 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 
444 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 
448 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  34.52 
 
 
415 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  26.81 
 
 
295 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 
412 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 
412 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  28.08 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 
398 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5164  RDD domain containing protein  26.71 
 
 
142 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  32.41 
 
 
150 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  34.12 
 
 
376 aa  41.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  31.13 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  31.18 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  30.94 
 
 
235 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  34.67 
 
 
141 aa  41.2  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  42.03 
 
 
361 aa  41.2  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  28.48 
 
 
185 aa  40.8  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>