51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0098 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  27.56 
 
 
154 aa  59.7  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  40 
 
 
167 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  26.7 
 
 
270 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  31.08 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  26.17 
 
 
145 aa  55.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  26.38 
 
 
185 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  33.7 
 
 
166 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  30.61 
 
 
152 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  28.29 
 
 
163 aa  52.4  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  29.81 
 
 
169 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  39.53 
 
 
453 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  31.82 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  28.12 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  35.96 
 
 
162 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  31.11 
 
 
202 aa  48.9  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  30.87 
 
 
159 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  33.7 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  28.86 
 
 
170 aa  48.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  35.82 
 
 
295 aa  48.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  33.71 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  29.75 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  27.46 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  33.71 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  33.71 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  34.21 
 
 
198 aa  47  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  32.21 
 
 
159 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  25.28 
 
 
159 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  32.94 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  32.97 
 
 
406 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  33.73 
 
 
157 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  31.75 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  26.17 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0161  RDD  35.71 
 
 
328 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  25.17 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  33.77 
 
 
634 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  34.09 
 
 
444 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  30.18 
 
 
174 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 
448 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
536 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  34.09 
 
 
449 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  24.67 
 
 
257 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  23.75 
 
 
196 aa  42  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  34.57 
 
 
415 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 
415 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  28.47 
 
 
278 aa  41.6  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 
398 aa  41.6  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 
412 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  32.73 
 
 
375 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 
412 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>