60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0643 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  86.67 
 
 
196 aa  330  1e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  48.59 
 
 
198 aa  174  8e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  29.65 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  31.15 
 
 
169 aa  88.6  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  32.16 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  37.11 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  40.43 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  28.65 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.81 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  36.59 
 
 
149 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  34.12 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  37.65 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  32.93 
 
 
634 aa  58.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  26.71 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  31.01 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  25.99 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
536 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  30.08 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  24.55 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  33.33 
 
 
150 aa  53.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  41.77 
 
 
141 aa  52.8  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  26.73 
 
 
205 aa  51.6  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  23.93 
 
 
310 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  25.3 
 
 
165 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  27.66 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  34.83 
 
 
295 aa  51.2  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0792  hypothetical protein  27.03 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  27.81 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  34.04 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  26.8 
 
 
162 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 
157 aa  48.5  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  36.11 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  34.21 
 
 
145 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  23.21 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  35.71 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  35.29 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  37.21 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  36.76 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  32.89 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 
415 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  34.29 
 
 
278 aa  45.1  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  37.31 
 
 
151 aa  45.1  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  25.27 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  30.38 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  32.58 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  25.48 
 
 
133 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  33.82 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  32.35 
 
 
150 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  33.33 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 
272 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  32.35 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  31.87 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  32.35 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  29.79 
 
 
221 aa  41.6  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  21.79 
 
 
159 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  33.85 
 
 
198 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>