52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0769 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  37.74 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  34.38 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  33.75 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  35 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.1 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  32.28 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  33.96 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  32.1 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  27.67 
 
 		 257 aa  60.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  29.34 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  32.3 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  31.48 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  25.6 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  31.93 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  30.82 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  27.63 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  29.81 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  37.88 
 
 		 278 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  24.18 
 
 		 270 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  29.94 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  32.94 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  38.46 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 186 aa  48.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  29.87 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  23.21 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  30.57 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  31.94 
 
 		 198 aa  47.4  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  30.23 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  24.18 
 
 		 634 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  36.78 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  26.01 
 
 		 447 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49805  predicted protein  29.88 
 
 		 389 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  39.39 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  25.81 
 
 		 156 aa  43.9  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  31.4 
 
 		 195 aa  43.9  0.0009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  29.58 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  39.73 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  36.49 
 
 		 449 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  36.49 
 
 		 448 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  36.49 
 
 		 444 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  35.14 
 
 		 415 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  31.17 
 
 		 590 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  35.14 
 
 		 412 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0342  RDD protein  28.18 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  35.14 
 
 		 415 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  35.14 
 
 		 412 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  35.14 
 
 		 398 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  36.49 
 
 		 376 aa  41.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  27.74 
 
 		 264 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2282  RDD domain containing protein  27.45 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  26.28 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>