74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1596 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  78.4 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  44.96 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  45.27 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  33.05 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  35.74 
 
 		 590 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  34.23 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  43.59 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  44.22 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  40.26 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  41.04 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  38.6 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  42.86 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  38.56 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  38.92 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  32.73 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  28.25 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  33.18 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  34.5 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  28.36 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  33.66 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  37.32 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  28.98 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  29.64 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  31.79 
 
 		 151 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  29.7 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  28.08 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  27.6 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  31.48 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  34.09 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  32.93 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  31.63 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  27.03 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  28.89 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  30.86 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  36.16 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  42.86 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  29.65 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  31.55 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  27.06 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  27.06 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  27.06 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  31.21 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  29.53 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  42.86 
 
 		 80 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  30.38 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  32.87 
 
 		 169 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  30.4 
 
 		 340 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  30.82 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  26.06 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2516  RDD domain-containing protein  33.56 
 
 		 183 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2553  RDD domain-containing protein  33.56 
 
 		 183 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594635  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2561  RDD domain-containing protein  33.56 
 
 		 183 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.636636  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  28.19 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  33.67 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  28.68 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  26.76 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  24.57 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  26.62 
 
 		 406 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  28.19 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  27.71 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  29.57 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  27.83 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  32.32 
 
 		 635 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  33.71 
 
 		 165 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  30.3 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  29.5 
 
 		 167 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  31.47 
 
 		 152 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>