31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0238 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  316  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  35.5 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  33.53 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  33.83 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  33.08 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  34.06 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  34.06 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  33.08 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  36.5 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  31.33 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  32.32 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  32.86 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  36.09 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  33.81 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  31.43 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  32.03 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  31.65 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  33.55 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  31.11 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  31.11 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  38.37 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  28.4 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  30.38 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  32.5 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  30.37 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  32.5 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  30.99 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  32.62 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  26.13 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0674  RDD  22.78 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>