35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1112 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  100 
 
 		 152 aa  296  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  95.39 
 
 		 152 aa  285  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  71.33 
 
 		 152 aa  219  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  72.67 
 
 		 154 aa  218  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  54.48 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  51.8 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  51.8 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  51.47 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  43.15 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  42.47 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  41.56 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  41.94 
 
 		 181 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  40.4 
 
 		 175 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  41.89 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  42.11 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  40.13 
 
 		 188 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  42.54 
 
 		 157 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  37.91 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  35.53 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  38.35 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  35.03 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  35.03 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  36.03 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  41.61 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  32.08 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  34.42 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  29.03 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  29.22 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  28.93 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  26.56 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  36.54 
 
 		 424 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0331  RDD family protein  25.64 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  29.5 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  30.77 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>