26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7575 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  100 
 
 		 173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  81.36 
 
 		 177 aa  270  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  62.96 
 
 		 162 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  63.09 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  63.09 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  63.89 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  37.78 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  37.78 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  35.84 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  38.15 
 
 		 185 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  38.69 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  37.04 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  39.42 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  32.16 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  36.76 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  35.77 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  38.13 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  35.04 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  36.18 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  35.53 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  38.24 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  30.3 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  31.01 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  33.08 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  32.39 
 
 		 242 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>