27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4240 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  321  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  100 
 
 		 164 aa  321  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  93.29 
 
 		 164 aa  303  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  68.59 
 
 		 162 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  64.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  63.09 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  37.96 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  37.96 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  37.23 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  37.88 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  39.1 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  30.72 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  33.09 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  38.93 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  33.09 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  35.03 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  29.27 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  32.35 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  30.25 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  29.41 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  36.09 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  30.56 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  32.56 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  31.11 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  34.83 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  32.53 
 
 		 160 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>