30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2537 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  100 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  94.23 
 
 
156 aa  298  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  94.23 
 
 
156 aa  298  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  58.45 
 
 
152 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  56.72 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  55.97 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  49.68 
 
 
154 aa  140  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  54.48 
 
 
152 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  41.72 
 
 
180 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  41.67 
 
 
181 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  43.48 
 
 
179 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  39.13 
 
 
181 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  39.86 
 
 
185 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  42.75 
 
 
179 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  36.08 
 
 
188 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  39.42 
 
 
175 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  38.3 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  37.04 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  39.85 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  36.5 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  37.23 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  37.23 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  34.59 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  38.17 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  29.77 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  31.65 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  30.51 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  29.05 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>