27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4760 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  100 
 
 
164 aa  320  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  93.29 
 
 
164 aa  303  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  93.29 
 
 
164 aa  303  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  67.48 
 
 
162 aa  214  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  63.27 
 
 
177 aa  173  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  63.89 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  37.23 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  37.23 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  36.5 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  32.5 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  32.53 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  37.88 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  34.53 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  39.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  37.98 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  31.71 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  33.81 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  34.53 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  38.35 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  28.99 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  32.41 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  32.64 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  34.83 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  30.37 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  33.73 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>