36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2650 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2650  RDD  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  70.17 
 
 		 179 aa  263  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  70.11 
 
 		 181 aa  260  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  70.05 
 
 		 180 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  71.19 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  65.93 
 
 		 175 aa  240  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  62.57 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  51.48 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  42.21 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  39.87 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  40.58 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  37.57 
 
 		 175 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  36.08 
 
 		 156 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  35.44 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  35.44 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  40.52 
 
 		 152 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  40.13 
 
 		 152 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  37.2 
 
 		 157 aa  88.2  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  39.42 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  37.25 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  31.71 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  39.13 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  29.27 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  29.27 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  33.11 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  35.5 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  31.79 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  33.99 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  33.99 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  32.68 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  30.87 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  30.07 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  26.57 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  27.94 
 
 		 431 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  29.25 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>