18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1297 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  98.67 
 
 		 150 aa  296  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  88 
 
 		 150 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  52.86 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  51.45 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  39.6 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  33.99 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  29.05 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  33.56 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  31.76 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  30.14 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  32.21 
 
 		 185 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  31.51 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  32.19 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  33.08 
 
 		 175 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  26.85 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>