12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1927 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  100 
 
 		 431 aa  832    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  35.93 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05580  FHA domain-containing protein  41.57 
 
 		 128 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.12 
 
 		 2449 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  35.85 
 
 		 668 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  32.69 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  24.61 
 
 		 1888 aa  51.6  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3973  FHA domain-containing protein  31.73 
 
 		 446 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.825925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  34.09 
 
 		 537 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  34.19 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0963  forkhead domain protein  28.28 
 
 		 210 aa  46.6  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04060  uncharacterized conserved protein, contains FHA domain  34.62 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00580862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>