16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05580  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0455  FHA domain containing protein  55.1 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107862  normal  0.788327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  42.24 
 
 		 556 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  51.04 
 
 		 397 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  43.52 
 
 		 451 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  47.17 
 
 		 511 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04060  uncharacterized conserved protein, contains FHA domain  42.05 
 
 		 405 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00580862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1763  FHA domain containing protein  44.55 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1340  FHA domain containing protein  41.58 
 
 		 479 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.335677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  37.74 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  38.68 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  33.67 
 
 		 463 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0457  FHA domain containing protein  33.33 
 
 		 534 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  38.46 
 
 		 349 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  37.76 
 
 		 668 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  35.85 
 
 		 564 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>