38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1340 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1340  FHA domain containing protein  100 
 
 		 479 aa  909    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.335677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  27.1 
 
 		 556 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  41.61 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1763  FHA domain containing protein  41.54 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  42.99 
 
 		 668 aa  73.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  37.19 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0455  FHA domain containing protein  36.28 
 
 		 125 aa  65.1  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107862  normal  0.788327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05580  FHA domain-containing protein  40.59 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  32.48 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  38.83 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  38.18 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  28.98 
 
 		 272 aa  57  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0457  FHA domain containing protein  30.1 
 
 		 534 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  31.9 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  37.86 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  36.08 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  33.87 
 
 		 564 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  32.24 
 
 		 310 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  32.26 
 
 		 221 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  31.37 
 
 		 166 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1841  forkhead-associated protein  39.22 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.521298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  30.61 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  30.95 
 
 		 505 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2866  FHA domain containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.176528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  31.43 
 
 		 237 aa  47  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05600  FHA domain-containing protein  28.65 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.3344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  30.63 
 
 		 181 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  33.61 
 
 		 131 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  24.84 
 
 		 257 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  30.94 
 
 		 194 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  30.99 
 
 		 162 aa  44.3  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 498 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  30.32 
 
 		 261 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2200  FHA domain containing protein  34.26 
 
 		 585 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  decreased coverage  0.00361499 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0963  forkhead domain protein  27 
 
 		 210 aa  43.9  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  41.1 
 
 		 537 aa  43.5  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  27.46 
 
 		 295 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>