47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1756 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  100 
 
 
564 aa  1044    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2200  FHA domain containing protein  51.9 
 
 
585 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  decreased coverage  0.00361499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0457  FHA domain containing protein  45.58 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05600  FHA domain-containing protein  46.98 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.3344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07540  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 
614 aa  95.9  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1337  FHA domain containing protein  33.62 
 
 
697 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000206516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1293  FHA domain-containing protein  31.09 
 
 
598 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.584105  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21550  FHA domain-containing protein  44.55 
 
 
888 aa  94.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3941  forkhead-associated protein  45.27 
 
 
349 aa  93.6  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.394749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  37.61 
 
 
424 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0554  Forkhead-associated protein  46.15 
 
 
377 aa  87  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.965875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  40.91 
 
 
511 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  37.23 
 
 
556 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0455  FHA domain containing protein  33.64 
 
 
125 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107862  normal  0.788327 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  33.5 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  40 
 
 
489 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1340  FHA domain containing protein  34.55 
 
 
479 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.335677  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  39.58 
 
 
451 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  29.61 
 
 
668 aa  50.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1397  FHA domain containing protein  30.05 
 
 
512 aa  50.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0172432  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3539  Forkhead-associated protein  33.61 
 
 
371 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.953767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  46.94 
 
 
245 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2866  FHA domain containing protein  39.2 
 
 
208 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.176528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
1011 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  40.57 
 
 
484 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  37.5 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4098  FHA domain containing protein  34.45 
 
 
325 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  32.11 
 
 
498 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3973  FHA domain-containing protein  31.19 
 
 
446 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.825925  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0150  diguanylate cyclase  35.85 
 
 
289 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0139  diguanylate cyclase  35.85 
 
 
289 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  54.35 
 
 
539 aa  47  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  32.1 
 
 
2272 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  35.85 
 
 
289 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05580  FHA domain-containing protein  34.82 
 
 
128 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  38.24 
 
 
926 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4534  FHA domain-containing protein  33.04 
 
 
298 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.259874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3733  FHA domain containing protein  29.84 
 
 
172 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  0.0527204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  31.13 
 
 
463 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2434  FHA domain-containing protein  36.92 
 
 
284 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0872027  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  32.1 
 
 
2179 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  34.83 
 
 
991 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  46.3 
 
 
253 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  36.19 
 
 
537 aa  43.9  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3047  FHA domain-containing protein  37.93 
 
 
275 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  40.28 
 
 
701 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  39.68 
 
 
571 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>