20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3941 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3941  forkhead-associated protein  100 
 
 
349 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.394749  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  45.27 
 
 
564 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0457  FHA domain containing protein  45.97 
 
 
534 aa  92.8  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2200  FHA domain containing protein  43.59 
 
 
585 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  decreased coverage  0.00361499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0490  FHA domain containing protein  38.85 
 
 
578 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05600  FHA domain-containing protein  44 
 
 
502 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.3344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07540  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21550  FHA domain-containing protein  38.4 
 
 
888 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1293  FHA domain-containing protein  36.61 
 
 
598 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.584105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1337  FHA domain containing protein  33.93 
 
 
697 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000206516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  40 
 
 
424 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  36.11 
 
 
556 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0554  Forkhead-associated protein  35.19 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.965875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  39.64 
 
 
397 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  35.77 
 
 
451 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1841  forkhead-associated protein  32.73 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.521298  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  38.18 
 
 
511 aa  46.2  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  36.79 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  36.61 
 
 
668 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5899  hypothetical protein  32.46 
 
 
471 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529842  normal  0.0437244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>