26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3940 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  652    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  39.69 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  34.95 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  41.03 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1340  FHA domain containing protein  39.42 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.335677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  41.51 
 
 		 668 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  35.51 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  27.43 
 
 		 556 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1337  FHA domain containing protein  33.33 
 
 		 697 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000206516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0455  FHA domain containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107862  normal  0.788327 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0963  forkhead domain protein  29.29 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0554  Forkhead-associated protein  37 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.965875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05580  FHA domain-containing protein  38.46 
 
 		 128 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1293  FHA domain-containing protein  35.58 
 
 		 598 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.584105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0367  FHA domain-containing protein  38.64 
 
 		 529 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  decreased coverage  0.000756141 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2866  FHA domain containing protein  33.54 
 
 		 208 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.176528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  33.7 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  35.54 
 
 		 424 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3941  forkhead-associated protein  33.75 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.394749  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  42.31 
 
 		 511 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4250  FHA domain-containing protein  40.74 
 
 		 547 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05600  FHA domain-containing protein  37.27 
 
 		 502 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.3344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4044  FHA domain-containing protein  26.32 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04060  uncharacterized conserved protein, contains FHA domain  35.71 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00580862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  29.25 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07540  FHA domain-containing protein  30.19 
 
 		 614 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.118463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>