26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21570 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  100 
 
 
668 aa  1305    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  40.65 
 
 
451 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1340  FHA domain containing protein  42.99 
 
 
479 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.335677  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  34.92 
 
 
556 aa  68.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  42.72 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04060  uncharacterized conserved protein, contains FHA domain  37.61 
 
 
405 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00580862  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1763  FHA domain containing protein  42.98 
 
 
453 aa  62  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  41.51 
 
 
349 aa  58.9  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0457  FHA domain containing protein  32.78 
 
 
534 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  33.08 
 
 
463 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2200  FHA domain containing protein  35.19 
 
 
585 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  decreased coverage  0.00361499 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05600  FHA domain-containing protein  35.65 
 
 
502 aa  52.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.3344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
424 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  35.85 
 
 
431 aa  50.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  36.73 
 
 
511 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0806  RDD domain-containing protein  32.28 
 
 
224 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138466  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1397  FHA domain containing protein  32.41 
 
 
512 aa  48.5  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0172432  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  27.22 
 
 
272 aa  48.5  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3539  Forkhead-associated protein  34.21 
 
 
371 aa  48.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.953767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  39.39 
 
 
564 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  31.11 
 
 
310 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07540  FHA domain-containing protein  32.73 
 
 
614 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0490  FHA domain containing protein  36.73 
 
 
578 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05580  FHA domain-containing protein  37.76 
 
 
128 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21550  FHA domain-containing protein  33.03 
 
 
888 aa  45.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  34.51 
 
 
268 aa  43.9  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>