50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4250 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4250  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 547 aa  1011    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0367  FHA domain-containing protein  49.48 
 
 		 529 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  decreased coverage  0.000756141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0184  FHA domain containing protein  49.23 
 
 		 213 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4558  FHA domain-containing protein  47.97 
 
 		 233 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734696  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4402  FHA domain containing protein  43.85 
 
 		 236 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0891871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2164  Forkhead-associated protein  44.12 
 
 		 303 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2460  FHA domain-containing protein  45.97 
 
 		 325 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0199195  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4947  FHA domain-containing protein  43.07 
 
 		 187 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3067  FHA domain containing protein  39.23 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000453699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3733  FHA domain containing protein  39.13 
 
 		 172 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  0.0527204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1462  FHA domain-containing protein  37.04 
 
 		 173 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129326  normal  0.623454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2161  FHA domain-containing protein  36.21 
 
 		 173 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2822  FHA domain-containing protein  42.55 
 
 		 247 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000875758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  37.62 
 
 		 474 aa  53.9  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 		 505 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  42.22 
 
 		 526 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  38.46 
 
 		 152 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2339  FHA domain containing protein  40 
 
 		 146 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2541  FHA domain-containing protein  39.78 
 
 		 247 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4010  FHA domain containing protein  37.78 
 
 		 156 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.196899  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  32.99 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3031  FHA domain-containing protein  41.25 
 
 		 278 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299577  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  33.72 
 
 		 228 aa  47.8  0.0006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4044  FHA domain-containing protein  36.96 
 
 		 172 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 		 177 aa  47  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2775  Forkhead-associated protein  37.78 
 
 		 149 aa  47  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 		 158 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 		 157 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  40.74 
 
 		 349 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 		 158 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 		 183 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 		 158 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4212  adenylate/guanylate cyclase  39.74 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  35.29 
 
 		 882 aa  46.2  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4430  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.206404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  39.56 
 
 		 152 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11857  hypothetical protein  36.67 
 
 		 162 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4251  adenylate/guanylate cyclase  39.74 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0807757  hitchhiker  0.000000663709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2866  FHA domain containing protein  39.18 
 
 		 208 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.176528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  36.26 
 
 		 408 aa  45.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5356  FHA domain containing protein  40.66 
 
 		 150 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  40.86 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  33.11 
 
 		 475 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0534  FHA domain-containing protein  45.45 
 
 		 272 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.895952  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1482  FHA domain containing protein  43.84 
 
 		 237 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.30072  normal  0.365502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1456  FHA domain containing protein  43.84 
 
 		 237 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  35.56 
 
 		 170 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0140  FHA domain-containing protein  34.07 
 
 		 533 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425814  hitchhiker  0.00649643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  38.04 
 
 		 181 aa  43.9  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4216  FHA domain-containing protein  39.74 
 
 		 287 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000473857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>