19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04060  uncharacterized conserved protein, contains FHA domain  100 
 
 		 405 aa  757    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00580862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  40.43 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05580  FHA domain-containing protein  37.6 
 
 		 128 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  36.21 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  37.61 
 
 		 668 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  34.62 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0455  FHA domain containing protein  33.64 
 
 		 125 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107862  normal  0.788327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  43.3 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  42.31 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  32.89 
 
 		 246 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  33.6 
 
 		 262 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1841  forkhead-associated protein  39.53 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.521298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5899  hypothetical protein  33.66 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529842  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  36.51 
 
 		 1424 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  32.28 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 537 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  34.26 
 
 		 498 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1397  FHA domain containing protein  28.42 
 
 		 512 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0172432  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21550  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 		 888 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>