21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05600  FHA domain-containing protein  100 
 
 
502 aa  951    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.3344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2200  FHA domain containing protein  55.92 
 
 
585 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  decreased coverage  0.00361499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  46.98 
 
 
564 aa  110  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0490  FHA domain containing protein  49.11 
 
 
578 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1293  FHA domain-containing protein  45.54 
 
 
598 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.584105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1337  FHA domain containing protein  43.09 
 
 
697 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000206516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  43.71 
 
 
424 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07540  FHA domain-containing protein  46.43 
 
 
614 aa  94.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21550  FHA domain-containing protein  45.69 
 
 
888 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3941  forkhead-associated protein  44 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.394749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0554  Forkhead-associated protein  39.05 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.965875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  41.67 
 
 
451 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  35.34 
 
 
556 aa  63.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1841  forkhead-associated protein  29.19 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.521298  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  35.65 
 
 
668 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  32.71 
 
 
511 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1397  FHA domain containing protein  35.05 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0172432  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1340  FHA domain containing protein  30.69 
 
 
479 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.335677  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3940  RDD domain-containing protein  37.27 
 
 
349 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  38.37 
 
 
289 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3067  FHA domain containing protein  34.95 
 
 
272 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>